Основними функціями комплексу Гольджі є зберігання, перетворення та експорт речовин із клітин. Виводячись цією структурою, речовини надходять в інші частини тіла.
Комплекс Гольджі, коротко кажучи, органела, пов’язана з виробництвом, обробкою, упаковкою та адресацією ряду речовин у клітині.
Деякі інші захворювання є наслідком збою в роботі апарату Гольджі Хвороба Вільсона (або гепатолентикулярна дегенерація), при якій генетична мутація призводить до затримки білків в апараті, м'язова дистрофія Дюшенна та синдром Аарскога, в якому спостерігається зменшення трафіку Гольджі.
Комплекс Гольджі є органелою з кількома функціями, тому він вважається необхідним для оптимального функціонування клітин. Серед функцій комплексу Гольджі можна відзначити виробництво макромолекул такі як полісахариди.
Функції цитоплазми Сприяє обміну речовин всередині клітини і між сусідніми клітинами; Завдяки наявності цитоскелета цитоплазма підтримує клітину та забезпечує її рух у випадку клітин з амебоїдним рухом.
Основну функцію мають центріолі розділення генетичного матеріалу при поділі клітини та здатність утворювати війки та джгутики.
